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　　一、使用環境的區別：

　　A、生物安全柜一般是做致病菌，霉菌酵母菌來用，其操作區域是負壓的，簡單說是往外抽風的，當然致病菌也不是直接抽出排到室外，而是過濾在生物安全柜的頂部漏器上，從排風量上可以分為，50%外排型，75%以及100%外排型。

　　B、而超凈工作臺是做一般對人體沒有直接傷害的常規細菌的操作實驗，正壓送風，吹向樣品以及實驗人員的風是經過過濾器過濾，從而達到局部百級。

　　二、使用目的的區別：

　　A、生物安全柜是為操作原代培養物、菌毒株以及診斷性標本等具有感染性的實驗材料時，用來保護工作人員、實驗室環境以及實驗品，使其避免暴露于上述操作過程中可能產生的感染性氣溶膠和濺出物而設計的。其目的是保護實驗過程、操作人員及環境免受危害。通風柜和超凈工作臺不屬于生物安全柜，不可使用在涉及微生物材料的實驗或生產過程中。

　　B、超凈工作臺是為了保護試驗品或產品而設計的，通過吹過工作區域的垂直或水平層流空氣防止試驗品或產品受到工作區域外粉塵或細菌的污染。一旦微生物樣品放置于工作區域，層流空氣將把帶有微生物介質的空氣吹向前臺工作人員而產生危險。超凈工作臺就相當于一個縮小版的無菌室（無菌空間）。